RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457188.6

CMTM1-206, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 765 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-206ENST00000457188 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 MAP3K11Q16584 847 aa14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 WNK4Q96J92 1243 aa14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 BRCA2P51587 3418 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 F8W031 263 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 KLRK1P26718 216 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 FLIIQ13045 1269 aa14.71□□□□□ -0.05
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CMTM1-206ENST00000457188 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 LINS1Q8NG48 757 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-206ENST00000457188 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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CMTM1-206ENST00000457188 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CSF1RP07333 972 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CFAP100Q494V2 611 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 SPDYE6P0CI01 402 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 EFCC1Q9HA90 598 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 FZD1Q9UP38 647 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CACNA1FO60840 1977 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 TAF5LO75529 589 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CCDC27Q2M243 656 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 G2E3Q7L622 706 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 IL1R1P14778 569 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 SP3Q02447 781 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CRHR2Q13324 411 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 NBPF11Q86T75 865 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CERS5Q8N5B7 392 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 IL16Q14005 1332 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 PLIN1O60240 522 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 TNNI2P48788 182 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 RASA3Q14644 834 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 WWC1Q8IX03 1113 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CASP7P55210 303 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 OPTNQ96CV9 577 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 CSADQ9Y600 493 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-206ENST00000457188 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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CMTM1-206ENST00000457188 POTEFA5A3E0 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 SNAP23O00161 211 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 VPS37DQ86XT2 251 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 ELP3Q9H9T3 547 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 JAG2Q9Y219 1238 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 LAMB1P07942 1786 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 GTF2A2P52657 109 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 ARMC5Q96C12 935 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 FOXO4P98177 505 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 KIF22Q14807 665 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 HOOK2Q96ED9 719 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 A0A1B0GUL6 1792 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 GRM8O00222 908 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 UBE4AQ14139 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 CCL15Q16663 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-206ENST00000457188 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.6□□□□□ -0.07
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