RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NHS1 94 aa11.68□□□□□ -0.54
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF3P18847 181 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNNI2P48788 182 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf49Q9H741 205 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.68□□□□□ -0.54
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.67□□□□□ -0.54
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.66□□□□□ -0.54
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.64□□□□□ -0.55
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INPP5BP32019 993 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBL2Q08999 1139 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOGA3Q5TF21 947 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEIOBQ8N635 442 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHACTR2O75167 634 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRS1P35568 1242 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXC1Q12948 553 aa11.58□□□□□ -0.56
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