RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 UBE3CQ15386 1083 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 CRY2Q49AN0 593 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 VPS37DQ86XT2 251 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 PKP1Q13835 747 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 DOCK2Q92608 1830 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 LARGE1O95461 756 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 RPS6KB1P23443 525 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 MAP3K12Q12852 859 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 KRT32Q14532 448 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 NEK1Q96PY6 1258 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 FGAP02671 866 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 ABCF2Q9UG63 623 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 MSL1Q68DK7 614 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 HAND2P61296 217 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-207ENST00000436724 DTNBO60941 627 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 AIDAQ96BJ3 306 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 E7EWF7 191 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 MMP10P09238 476 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ME3Q16798 604 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 LAMA4Q16363 1823 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 MCM4P33991 863 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 MBD4O95243 580 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 APPP05067 770 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 GPSM2P81274 684 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ARMT1Q9H993 441 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 RAI14Q9P0K7 980 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 JAG2Q9Y219 1238 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 XDHP47989 1333 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 NECAB1Q8N987 351 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 NUCB2P80303 420 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ST3GAL1Q11201 340 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 Q6ZUG5 572 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 LCORLQ8N3X6 602 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-207ENST00000436724 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 CYP7A1P22680 504 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 CHST3Q7LGC8 479 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 ANKRD1Q15327 319 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 SLC15A2Q16348 729 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF384Q8TF68 577 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 SEMA3EO15041 775 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 PRKAB2O43741 272 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 BBOX1O75936 387 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRF-207ENST00000436724 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms