RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB16Q96NS5 453 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP20Q9Y2K6 914 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBX22Q9Y458 520 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFB5O43674 189 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHA2P01877 340 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDGFAP04085 211 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATF3P18847 181 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGA6P23229 1130 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARSDP51689 593 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREML4Q6UXN2 200 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC7Q7Z402 723 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP63Q96MT8 703 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.48□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 JCADQ9P266 1359 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C1W4 665 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPFIA3O75145 1194 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM129BQ96TA1 746 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCN2Q9UL51 889 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRB1O14514 1584 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.47□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.46□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NHS1 94 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TECPR2O15040 1411 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRINP3Q76B58 766 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJD3Q8N144 294 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 CITED4Q96RK1 184 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD7Q9NPI1 651 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK26Q9P289 416 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 EP400Q96L91 3159 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.46□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR182O15218 404 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM157BP0CG42 384 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC3P19447 782 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNP2Q05952 138 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC1Q8TDI8 760 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PXDNQ92626 1479 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALS2Q96Q42 1657 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLC1Q96QB1 1528 aa6.45□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFSO43281 561 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 BNIP3LO60238 219 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP5P45974 858 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf34Q49A92 452 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMCL1Q96IK5 515 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 STRN4Q9NRL3 753 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRAPQ86VF7 1730 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.44□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREHO43280 583 aa6.43□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPB42P16452 691 aa6.43□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCSK2P16519 638 aa6.43□□□□□ -1.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNQ4P56696 695 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms