RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 PSMA5P28066 241 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC102BQ68D86 513 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RIMBP2O15034 1052 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SYT1P21579 422 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MCAMP43121 646 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 G3V3G9 751 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 HIP1O00291 1037 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 TRDNQ13061 729 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 TSPY26PQ9H489 355 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SLIT3O75094 1523 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 GPAA1O43292 621 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MBD4O95243 580 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CASP7P55210 303 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 HS1BP3Q53T59 392 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 DCCP43146 1447 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SMIM22K7EJ46 135 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 STX6O43752 255 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC5A1P13866 664 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 BICD2Q8TD16 824 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 HAUS7Q99871 368 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 B4E1Z4 1266 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF213O14771 459 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP7A1P22680 504 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 KLRK1P26718 216 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CHRNDQ07001 517 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 OGFRQ9NZT2 677 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MAST3O60307 1309 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 C6orf229H3BNL8 230 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 USP48Q86UV5 1035 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT222Q8N1A0 295 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A087WWV3 80 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SKIDA1Q1XH10 827 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 NLRP3Q96P20 1036 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 NAPBQ9H115 298 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 GOLGA8BA8MQT2 603 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 PDE8BO95263 885 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 FGAP02671 866 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 OLFM4Q6UX06 510 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MAP4K1Q92918 833 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 FEZ1Q99689 392 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 NRDCO43847 1150 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF5P55010 431 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms