RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 GJA5P36382 358 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 KIF22Q14807 665 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 FBXW7Q969H0 707 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 GGA1Q9UJY5 639 aa11.91□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 LAMB2P55268 1798 aa11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 GJA8P48165 433 aa11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 TERF1P54274 439 aa11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.9□□□□□ -0.5
AP000289.1-201ENST00000421051 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.9□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ERBB4Q15303 1308 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 BCAMP50895 628 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 SLFN5Q08AF3 891 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PDE3AQ14432 1141 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 MAP3K11Q16584 847 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 RNF208Q9H0X6 261 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.89□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ANXA1P04083 346 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 GJB1P08034 283 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 MCM4P33991 863 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PODNQ7Z5L7 613 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CCL5P13501 91 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 BMP8BP34820 402 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 GOLGA2Q08379 1002 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 COPS6Q7L5N1 327 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM89AQ96GI7 184 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.87□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 OPTNQ96CV9 577 aa11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ELP3Q9H9T3 547 aa11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 UNCXA6NJT0 531 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ESPNB1AK53 854 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 GRK4P32298 578 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PRMT2P55345 433 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PDIA6Q15084 440 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 PROSER3Q2NL68 480 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 LRIT3Q3SXY7 679 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 RAET1EQ8TD07 263 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 GDF15Q99988 308 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.85□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 GNRH1P01148 92 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CCL15Q16663 113 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 DACT2Q5SW24 774 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM122AQ96E09 287 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 TRIM47Q96LD4 638 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 RPTORQ8N122 1335 aa11.84□□□□□ -0.51
AP000289.1-201ENST00000421051 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 TLR2O60603 784 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 SGPL1O95470 568 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 UBXN2AP68543 259 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM161BQ96MY7 647 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 PTMSP20962 102 aa11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 ATP2B4P23634 1241 aa11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 HOXD10P28358 340 aa11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 PSMC4P43686 418 aa11.82□□□□□ -0.52
AP000289.1-201ENST00000421051 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms