RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 GNPATO15228 680 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 A1BGP04217 495 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRJ-201ENST00000418331 ERICH4A6NGS2 130 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 POTEB2H3BUK9 544 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRJ-201ENST00000418331 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 STX17P56962 302 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 HOOK3Q86VS8 718 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT13P13646 458 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX11Q8IYF3 940 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D5Q92609 795 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.3■■□□□ 1.48
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