RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 VEZTQ9HBM0 779 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PIK3R4Q99570 1358 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 BRAPQ7Z569 592 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K12Q12852 859 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SWAP70Q9UH65 585 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 GBP1P32455 592 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NSD2O96028 1365 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ATL3Q6DD88 541 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 DESI2Q9BSY9 194 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PTPRKQ15262 1439 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB22O15209 634 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ATP1A2P50993 1020 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CCDC38Q502W7 563 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PSMB7Q99436 277 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TRIM75PA6NK02 468 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 BMP15O95972 392 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NLRP12P59046 1061 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ASIC1P78348 528 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 IFT20Q8IY31 132 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FAM71BQ8TC56 605 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MYO1CO00159 1063 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ICE2Q659A1 982 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PAF1Q8N7H5 531 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NESP48681 1621 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 VCXQ9H320 206 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 STRN4Q9NRL3 753 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 KRT24Q2M2I5 525 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NR1I2O75469 434 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RPS6KB1P23443 525 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CLCN6P51797 869 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R7Q15435 360 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RTN1Q16799 776 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ZNF202O95125 648 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SETSIPP0DME0 302 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 ALDH3A1P30838 453 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 WTAPQ15007 396 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MED4Q9NPJ6 270 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 CETN1Q12798 172 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 SNCBQ16143 134 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 VSIG1Q86XK7 387 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-202ENST00000402738 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms