RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.04■■□□□ 1.12
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SNX11-201ENST00000359238 PHKA1P46020 1223 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 KCNB2Q92953 911 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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SNX11-201ENST00000359238 AK2P54819 239 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 UVSSAQ2YD98 709 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 LARGE1O95461 756 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 M0R2C6 588 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 FGFR2P21802 821 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 FGD1P98174 961 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 RUFY3Q7L099 469 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 NYXQ9GZU5 481 aa22.01■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 ADRA2BP18089 450 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 KCNJ4P48050 445 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 CBX1P83916 185 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 NFIXQ14938 502 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 KIF3AQ9Y496 699 aa22.01■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 FAM184AQ8NB25 1140 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 OSBP2Q969R2 916 aa22■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 COL24A1Q17RW2 1714 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 A0A1B0GUL6 1792 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 CCDC102BQ68D86 513 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 MYH7P12883 1935 aa21.99■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF827Q17R98 1081 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 BRD1O95696 1058 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 GYS1P13807 737 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 TSC1Q92574 1164 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 RTL9Q8NET4 1388 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 PLSCR1O15162 318 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 FOXP2O15409 715 aa21.98■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.97■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.97■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.97■■□□□ 1.11
SNX11-201ENST00000359238 LAMA4Q16363 1823 aa21.96■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 CYP21A2P08686 494 aa21.96■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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SNX11-201ENST00000359238 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 BCAMP50895 628 aa21.95■■□□□ 1.1
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SNX11-201ENST00000359238 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.95■■□□□ 1.1
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SNX11-201ENST00000359238 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 MCM2P49736 904 aa21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 RASGRF1Q13972 1273 aa21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 CNBD1Q8NA66 436 aa21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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SNX11-201ENST00000359238 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 AKT1S1Q96B36 256 aa21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.92■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 WASHC4Q2M389 1173 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 KLRK1P26718 216 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 ME3Q16798 604 aa21.9■■□□□ 1.1
SNX11-201ENST00000359238 NECAB1Q8N987 351 aa21.9■■□□□ 1.1
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