RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DGKZQ13574 1117 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF11Q86T75 865 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 DPP9Q86TI2 863 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM75PA6NK02 468 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY2A6NKD2 308 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF76P36508 570 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CACNB3P54284 484 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL9Q07325 125 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LDHDQ86WU2 507 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MYO9BQ13459 2157 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CAMTA2O94983 1202 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SRGNP10124 158 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 WRNIP1Q96S55 665 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD14O00487 310 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA6P17066 643 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SCARF1Q14162 830 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 POTEDQ86YR6 584 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 COA7Q96BR5 231 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CSRNP1Q96S65 589 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM17Q9Y577 477 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SREBF2Q12772 1141 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ELP3Q9H9T3 547 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SNAP23O00161 211 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RLBP1P12271 317 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NOGQ13253 232 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LPIN2Q92539 896 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CAPNS2Q96L46 248 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRCP08575 1304 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD5Q99666 1765 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF26B4DH59 902 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GPSM2P81274 684 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PDE4BQ07343 736 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RNF20Q5VTR2 975 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF15Q8N660 670 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D4AQ9H788 454 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LRP6O75581 1613 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NCAPD2Q15021 1401 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CCNA1P78396 465 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 AKT1S1Q96B36 256 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MEIS3Q99687 375 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TNS2Q63HR2 1409 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 USP54Q70EL1 1684 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 B4DLN1 442 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPP22059 807 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RFX1P22670 979 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN2AP68543 259 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GPC2Q8N158 579 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 EFCC1Q9HA90 598 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ZHX2Q9Y6X8 837 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2B1P20020 1258 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 UBE4AQ14139 1066 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RASA3Q14644 834 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF3Q9H094 633 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.28□□□□□ -1.56
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