RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 SPATA5Q8NB90 893 aa20.18■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.18■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 SOCS7O14512 581 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 STX6O43752 255 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 PHF14O94880 888 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.17■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 NECAB1Q8N987 351 aa20.17■□□□□ 0.82
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SSR4-201ENST00000320857 SYT1P21579 422 aa20.16■□□□□ 0.82
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SSR4-201ENST00000320857 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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SSR4-201ENST00000320857 NLRP3Q96P20 1036 aa20.16■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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SSR4-201ENST00000320857 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.14■□□□□ 0.82
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SSR4-201ENST00000320857 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.14■□□□□ 0.81
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SSR4-201ENST00000320857 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.12■□□□□ 0.81
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SSR4-201ENST00000320857 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.07■□□□□ 0.8
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SSR4-201ENST00000320857 CNBD1Q8NA66 436 aa20.07■□□□□ 0.8
SSR4-201ENST00000320857 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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SSR4-201ENST00000320857 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.07■□□□□ 0.8
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