RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 GTF3C6Q969F1 213 aa21.9■■□□□ 1.1
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HCLS1-201ENST00000314583 SETDB2Q96T68 719 aa21.9■■□□□ 1.1
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HCLS1-201ENST00000314583 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.89■■□□□ 1.1
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HCLS1-201ENST00000314583 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.89■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 GPAA1O43292 621 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 ADRA2BP18089 450 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.88■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.87■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 PDE6AP16499 860 aa21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 STK3Q13188 491 aa21.85■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K12Q12852 859 aa21.84■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.84■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.84■■□□□ 1.09
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.84■■□□□ 1.09
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HCLS1-201ENST00000314583 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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HCLS1-201ENST00000314583 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.82■■□□□ 1.08
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HCLS1-201ENST00000314583 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 SCRN1Q12765 414 aa21.81■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 NFIXQ14938 502 aa21.81■■□□□ 1.08
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HCLS1-201ENST00000314583 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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HCLS1-201ENST00000314583 EVCP57679 992 aa21.8■■□□□ 1.08
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HCLS1-201ENST00000314583 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 PROM2Q8N271 834 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 TM4SF1P30408 202 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-201ENST00000314583 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.78■■□□□ 1.08
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