RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 MCAMP43121 646 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PPFIA3O75145 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 HAND2P61296 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 SPEF2Q9C093 1822 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT85P78386 507 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 LAMA4Q16363 1823 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 BCORQ6W2J9 1755 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 FOSBP53539 338 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 TICAM2Q86XR7 235 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 PFKFB2O60825 505 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 NARFQ9UHQ1 456 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 ZPR1O75312 459 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 CTDNEP1O95476 244 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 NTSR2O95665 410 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 AK7Q96M32 723 aa22.08■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.08■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 C4BP0C0L5 1744 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 FGAP02671 866 aa22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 APPBP2Q92624 585 aa22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.06■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SNAP23O00161 211 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PDE8BO95263 885 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PHKA1P46020 1223 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 RESTQ13127 1097 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 H3BQV1 296 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 GPAA1O43292 621 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 LIG1P18858 919 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 IFFO2Q5TF58 517 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.05■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.04■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 RFC4P35249 363 aa22.04■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC102BQ68D86 513 aa22.04■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA32Q96LK8 384 aa22.04■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ELP1O95163 1332 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SCN7AQ01118 1682 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC12Q96J65 1359 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.03■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ERFEQ4G0M1 354 aa22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 SETDB2Q96T68 719 aa22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PDLIM4-201ENST00000253754 APBA3O96018 575 aa22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ADD2P35612 726 aa22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 CAMK4Q16566 473 aa22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 WWC3Q9ULE0 1092 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC152Q4G0S7 254 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 PROM2Q8N271 834 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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