RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM27P14373 513 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 IL27Q8NEV9 243 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 KRT2P35908 639 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DNM2P50570 870 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 STRN3Q13033 797 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 LINS1Q8NG48 757 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GCP02774 474 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TRPC3Q13507 836 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC169A6NNP5 214 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PSMC4P43686 418 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MXRA7P84157 204 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DLGAP5Q15398 846 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ARID5AQ03989 594 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FBF1Q8TES7 1133 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 KIFC2Q96AC6 838 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 BICDL2A1A5D9 508 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ALDH1B1P30837 517 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PPIP5K2O43314 1243 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ZWINTO95229 277 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RASA3Q14644 834 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CFAP58Q5T655 872 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CTR9Q6PD62 1173 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 IL16Q14005 1332 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CAVIN2O95810 425 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CERS3Q8IU89 383 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CCT6BQ92526 530 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DHX58Q96C10 678 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 IQGAP2Q13576 1575 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF165P49910 485 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TNFAIP1Q13829 316 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NSMFQ6X4W1 530 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 DAPK3O43293 454 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CHMP2AO43633 222 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NR1I2O75469 434 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CNGA1P29973 690 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MCM7P33993 719 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NOX5Q96PH1 765 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NBPF3Q9H094 633 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CEP135Q66GS9 1140 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CPXCR1Q8N123 301 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 KRT5P13647 590 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GABPAQ06546 454 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZUG5 572 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CHST3Q7LGC8 479 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NEK11Q8NG66 645 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC114Q96M63 670 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TTC22Q5TAA0 569 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TACC1O75410 805 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms