RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mapk4Q6P5G0 583 aa13.9□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NexnQ7TPW1 607 aa13.9□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf784Q8BI69 297 aa13.9□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ripk4Q9ERK0 786 aa13.9□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Skor2A7M7C7 1008 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr66E9Q743 1299 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NrdcQ8BHG1 1161 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Crlf2Q8CII9 359 aa13.89□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fzd1O70421 642 aa13.88□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 HellsQ60848 821 aa13.88□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cnksr2Q80YA9 1032 aa13.88□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Smc4Q8CG47 1286 aa13.88□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rnf208Q8K0W3 265 aa13.88□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zap70P43404 618 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klrg2Q3UM83 387 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam205cQ80YD3 371 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mbtps2Q8CHX6 515 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmc2Q8R4P4 888 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekho1Q9JIY0 408 aa13.87□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GabrdP22933 449 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Otud5Q3U2S4 566 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gnat3Q3V3I2 354 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem39bQ810L4 492 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trmt44Q9D2Q2 713 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc81Q9D5W4 654 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd50F7BE84 1390 aa13.86□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpr182P43142 395 aa13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Map3k12Q60700 888 aa13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SpidrQ8BGX7 933 aa13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CpdO89001 1377 aa13.85□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm6268A2A3U9 297 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp2b10P12791 500 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Chl1P70232 1209 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 VgfQ0VGU4 617 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lgr6Q3UVD5 967 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm11437Q5QR91 290 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Jarid2Q62315 1234 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CrkQ64010 304 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bend3Q6PAL0 825 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Itgbl1Q8VDV0 494 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ParvgQ9ERD8 331 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Il21rQ9JHX3 529 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cry2Q9R194 592 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa13.84□□□□□ -0.19
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prss51A0A286YDY8 319 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rhbdl3P58873 404 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zscan21Q07231 555 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gprin1Q3UNH4 932 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Neurod2Q62414 383 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekha4Q8VC98 588 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmod2Q9JKK7 351 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Syt5Q9R0N5 386 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plcg1Q62077 1302 aa13.83□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lca5lQ8C0X0 741 aa13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ero1bQ8R2E9 467 aa13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Exoc6Q8R313 802 aa13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mast3Q3U214 1321 aa13.82□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Clrn2B2RVW2 232 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Grm8P47743 908 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam83bQ0VBM2 1012 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gxylt1Q3UHH8 404 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gba2Q69ZF3 918 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Syne4Q8CII8 388 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vamp4O70480 141 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CnpP16330 420 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eps15P42567 897 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GpkowQ56A08 488 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prpf40bQ80W14 870 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Spata21Q8BHW6 681 aa13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krt28A6BLY7 462 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cacnb3P54285 484 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pdlim7Q3TJD7 457 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wbp1lQ8BGW2 348 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PpatQ8CIH9 517 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prkag2Q91WG5 566 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tll2Q9WVM6 1012 aa13.8□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea4F2Z493 315 aa13.79□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Aifm3Q3TY86 605 aa13.79□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm5592Q3V0A6 857 aa13.79□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CrbnQ8C7D2 445 aa13.79□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vmn1r199Q8R280 367 aa13.79□□□□□ -0.2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gbp7Q91Z40 638 aa13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms