RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Neurod6P48986 337 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Timm10P62073 90 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Map3k12Q60700 888 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CrkQ64010 304 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slain1Q68FF7 579 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pxylp1Q8BHA9 480 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 B3galt4Q9Z0F0 371 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CpdO89001 1377 aa28.31■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fgl2P12804 432 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atp8b2P98199 1209 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Srgap3Q812A2 1099 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NsmfQ99NF2 532 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccne2Q9Z238 404 aa28.3■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Izumo3A6PWV3 263 aa28.29■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SpidrQ8BGX7 933 aa28.29■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ift57Q8BXG3 429 aa28.29■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ripk3Q9QZL0 486 aa28.29■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa28.28■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trim58Q5NCC9 485 aa28.28■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zbtb3Q91X45 518 aa28.28■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 UncxO08934 530 aa28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 MycnP03966 462 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gsdma2Q32M21 443 aa28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 ParnQ8VDG3 624 aa28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 EhhadhQ9DBM2 718 aa28.27■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prkg1P0C605 671 aa28.26■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa28.26■■■□□ 2.12
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nphp3Q7TNH6 1325 aa28.25■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif22Q3V300 660 aa28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pram1Q6BCL1 675 aa28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Psen2Q61144 448 aa28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sirt2Q8VDQ8 389 aa28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam84aQ9D650 292 aa28.24■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prr14lE9Q7C4 1971 aa28.23■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NfkbibQ60778 359 aa28.23■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm3893E9Q1I1 302 aa28.22■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa28.22■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 TsksO54887 585 aa28.21■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 L3mbtl2P59178 703 aa28.21■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmprss11eQ5S248 423 aa28.21■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem179Q8BHH9 233 aa28.21■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Uba5Q8VE47 403 aa28.21■■■□□ 2.11
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Traf5P70191 558 aa28.2■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam102bQ8BQS4 339 aa28.2■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Bcs1lQ9CZP5 418 aa28.2■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 S1pr4Q9Z0L1 386 aa28.2■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col11a1Q61245 1804 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Usp17ldG5E8G2 545 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Usp17lcG5E8I7 545 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rnf181Q9CY62 165 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Jag1Q9QXX0 1218 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tanc1Q0VGY8 1856 aa28.19■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cacnb3P54285 484 aa28.18■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trpv1Q704Y3 839 aa28.18■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa28.18■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa28.18■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gxylt1Q3UHH8 404 aa28.17■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Snap47Q8R570 413 aa28.17■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prss51A0A286YDY8 319 aa28.16■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc7a3P70423 618 aa28.16■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CnpP16330 420 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Klrg2Q3UM83 387 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AsnsQ61024 561 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nlrp9aQ66X03 949 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem39bQ810L4 492 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mboat7Q8CHK3 473 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mkrn1Q9QXP6 481 aa28.15■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc4a1P04919 929 aa28.14■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mansc4Q3UU94 337 aa28.14■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tm4sf1Q64302 202 aa28.14■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abcc4E9Q236 1325 aa28.14■■■□□ 2.1
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tm6sf1P58749 370 aa28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Senp5Q6NXL6 749 aa28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mapk4Q6P5G0 583 aa28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ankrd13aQ80UP5 588 aa28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tuft1O08970 390 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prl7d1P04769 244 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Serpinb2P12388 415 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Washc4Q3UMB9 1173 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Krt74Q6IFZ9 495 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Asap2Q7SIG6 958 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Myh3P13541 1940 aa28.12■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa28.11■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Skint7A7XV04 395 aa28.11■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sulf1Q8K007 870 aa28.11■■■□□ 2.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 L1camP11627 1260 aa28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms