RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stx1aO35526 288 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm1Q60636 856 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acap3Q6NXL5 833 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grpel1Q99LP6 217 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col3a1P08121 1464 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pramel3A2AHA7 463 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7903A2AWL1 463 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AV320801A2AWL3 467 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm15023L7MUB4 467 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tpd52l1O54818 204 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp7a1Q64505 503 aa30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp2b1G5E829 1220 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh7Q91Z83 1935 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hps3Q91VB4 1002 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sil1Q9EPK6 465 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itga6Q61739 1091 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tpcn2Q8BWC0 731 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naa16Q9DBB4 864 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnpy2Q9QXT0 182 aa30.6■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube3bQ9ES34 1070 aa30.59■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnh4A2A5F7 1018 aa30.59■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ift57Q8BXG3 429 aa30.59■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irf5P56477 497 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stk38Q91VJ4 465 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc45Q9Z1X9 566 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr19Q3UGF1 1341 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm973E9Q295 1059 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sept1P42209 366 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Taok2Q6ZQ29 1240 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tlcd1Q99JT6 247 aa30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde8bE9Q4S1 865 aa30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lipo1J3QME6 396 aa30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hap1O35668 628 aa30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubn2Q80WC1 1314 aa30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl3d1P18121 224 aa30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxo4Q9WVH3 505 aa30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Oas2E9Q9A9 742 aa30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alx1Q8C8B0 326 aa30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Riok1Q922Q2 567 aa30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Odf2lQ9D478 642 aa30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmod1Q8BVA4 595 aa30.55■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh1Q5SX40 1942 aa30.55■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim34bJ3QNR8 485 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RdxP26043 583 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SrprbP47758 269 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adam1bQ8R534 806 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Greb1lB9EJV3 1913 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slfnl1Q8BHW9 410 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb43Q9DAI4 467 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp26a1O55127 497 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk4P30285 303 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pla2g4fQ50L41 855 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ano10Q8BH79 659 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DymQ8CHY3 669 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnk13Q8R1P5 405 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MetP16056 1379 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccng2O08918 344 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Jmjd4Q8BFT6 427 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam170aQ66LM6 333 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccz1Q8C1Y8 480 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc2Q8VDB8 371 aa30.52■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf326O88291 580 aa30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MsnP26041 577 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 XpcP51612 930 aa30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il17raQ60943 864 aa30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acnat2Q8BGG9 420 aa30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mei1Q9D4I2 1268 aa30.51■■■□□ 2.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8BZJ8 459 aa30.51■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifi35Q9D8C4 286 aa30.51■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde4dQ01063 747 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Llgl2Q3TJ91 1027 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc38a10Q5I012 1090 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sik1Q60670 779 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Metap2O08663 478 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myl10Q62082 202 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setdb1O88974 1307 aa30.5■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhf1Q3TB82 279 aa30.49■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irx4Q9QY61 515 aa30.49■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plbd2Q3TCN2 594 aa30.49■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Me1P06801 572 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde6aP27664 859 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm28047Q3US59 414 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nxf2Q4ZGD8 691 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ErmnQ5EBJ4 281 aa30.48■■■□□ 2.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.9 ms