RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPE	Q96AT9	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RCN3	Q96D15	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RERGL	Q9H628	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		M0R135	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MMP23A	O75900	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR7A10	O76100	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MT-ND1	P03886	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PEX2	P28328	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APOC4	P55056	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APOF	Q13790	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GALE	Q14376	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q8N9W7	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		G3V318	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H0YIZ8	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EBAG9	O00559	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBE2C	O00762	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPZL2	O60487	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSN3	P07498	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NCK1	P16333	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZP3	P21754	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SOX6	P35712	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC7A2	P52569	658 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRRX1	P54821	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TAS2R41	P59536	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RFX4	Q33E94	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A0G2JLM5	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		K7N7A8	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		M0QX08	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANGPT2	O15123	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AHCYL1	O43865	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC16A7	O60669	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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