RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ATP6AP2O75787 350 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PROSCO94903 275 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 RAB36O95755 333 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HPRT1P00492 218 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ORM1P02763 201 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TYMSP04818 313 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 FABP3P05413 133 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR5AC1P0C628 307 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 COX7A2P14406 83 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ABOP16442 354 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 GGT1P19440 569 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HIST1H2ADP20671 130 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CHRNB4P30926 498 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 GNG3P63215 75 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CAV1Q03135 178 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 LTBQ06643 244 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ZP4Q12836 540 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 GK3PQ14409 553 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CTF1Q16619 201 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SYTL3Q4VX76 610 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CBLN3Q6UW01 205 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TMUB2Q71RG4 321 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OAFQ86UD1 273 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 COPS8Q99627 209 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 NOX3Q9HBY0 568 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ASF1AQ9Y294 204 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 IDSB3KWA1 339 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R2P9O14990 202 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ZNHIT1O43257 154 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 BCHEP06276 602 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2-30P06310 120 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 IL1RNP18510 177 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 MPZP25189 248 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CMPK1P30085 196 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ARRB2P32121 409 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 GLP1RP43220 463 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CAMPP49913 170 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR10A3P58181 314 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TAS2R43P59537 309 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 BTG1P62324 171 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HERPUD1Q15011 391 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 MDS2Q8NDY4 140 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 UCN3Q969E3 161 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 MOAP1Q96BY2 351 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 YIPF6Q96EC8 236 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CCDC126Q96EE4 140 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SLC35E1Q96K37 410 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 FCRL5Q96RD9 977 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 F2RL3Q96RI0 385 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 MICU1Q9BPX6 476 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 HES7Q9BYE0 225 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SYT4Q9H2B2 425 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 Q9N2K0 584 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 NOX4Q9NPH5 578 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 RAB22AQ9UL26 194 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 POMPQ9Y244 141 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 OR5H1A6NKK0 313 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 E9PQ18 207 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 UPK1AO00322 258 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-212ENST00000535535 PHOX2AO14813 284 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms