RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDK10Q15131 360 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C12orf74Q32Q52 190 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGALS9BQ3B8N2 356 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF404Q494X3 552 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZCWPW2Q504Y3 356 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C10orf55Q5SWW7 151 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDZK1Q5T2W1 519 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM231DQ6ZW35 169 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 NIT1Q86X76 327 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC170Q8IYT3 715 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR52M1Q8NGK5 317 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C16orf78Q8WTQ4 265 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM62Q9BVG3 475 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PEX16Q9Y5Y5 336 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF609O15014 1411 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 NOS1P29475 1434 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-287P-201ENST00000516230 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5H14A6NHG9 310 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C19orf84I3L1E1 186 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARPC3O15145 178 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 GNRH2O43555 120 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 KERAO60938 352 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQP8O94778 261 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOX14O95416 240 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM50AO95807 157 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOD1P00441 154 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTHP01270 115 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD3DP04234 171 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 GYPCP04921 128 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGT2B4P06133 528 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINE2P07093 398 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRYGDP07320 174 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGA4P0DJD7 388 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGA3P0DJD8 388 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGA5P0DJD9 388 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABRA1P14867 456 aa-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-287P-201ENST00000516230 IMPA1P29218 277 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCND2P30279 289 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 LPAR6P43657 344 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPICP45877 212 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 RGS4P49798 205 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 INCA1Q0VD86 236 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ELOBQ15370 118 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TGFBIQ15582 683 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q1T7F1 81 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 UQCC3Q6UW78 93 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 BBS5Q8N3I7 341 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 C12orf29Q8N999 325 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 FADS6Q8N9I5 356 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF565Q8N9K5 539 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR9K2Q8NGE7 335 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCP10LQ8TDR4 215 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAL2Q969L2 176 aa-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-287P-201ENST00000516230 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-287P-201ENST00000516230 MAF1Q9H063 256 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC40Q9H9A6 602 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 TREX1Q9NSU2 369 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL19Q9UHD0 177 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 JPT1Q9UK76 154 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR90Q96KV7 1748 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKAP9Q99996 3911 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIF16BQ96L93 1317 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-287P-201ENST00000516230 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 C11orf86A6NJI1 115 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 F8WDY8 70 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLDN11O75508 207 aa-0.85□□□□□ -2.55
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