RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495899.1

MRPL55-233, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 2

Gene MRPL55, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-233	ENST00000495899	NPFF	O15130	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR2H2	O95918	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CALCB	P10092	127 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	EDDM3B	P56851	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DOC2B	Q14184	412 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RSU1	Q15404	277 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MED22	Q15528	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MIDN	Q504T8	468 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		Q6P435	159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SGCD	Q92629	289 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	S100A13	Q99584	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		Q9H521	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A0U1RQK1	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CSN2	P05814	226 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF44	P15621	663 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR3A1	P47881	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DLX6	P56179	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	P2RX3	P56373	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TPBG	Q13641	420 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GPR176	Q14439	515 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF273	Q14593	569 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	STAB1	Q9NY15	2570 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A1W2PPK0	400 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SIRPB1	O00241	398 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PIN1P1	O15428	100 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MELTF	P08582	738 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FBP1	P09467	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CCL3L1	P16619	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR3A4P	P47883	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ACTG1	P63261	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SCN1B	Q07699	218 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TRAM1	Q15629	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CORO2A	Q92828	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	UFD1	Q92890	307 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SC5D	O75845	299 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CDRT1	O95170	752 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	HTR3B	O95264	441 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GTF2F2	P13984	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SAA4	P35542	130 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IER3	P46695	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	KCNJ3	P48549	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PAX5	Q02548	391 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	KLRD1	Q13241	179 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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