RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 VAMP1P23763 118 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM42Q69YG0 159 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SEC22AQ96IW7 307 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 NICN1Q9BSH3 213 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 A0A0A6YYD4 124 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 MFNGO00587 321 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FPR2P25090 351 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PSMB6P28072 239 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 BSPH1Q075Z2 132 aa15.87■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 LRP11Q86VZ4 500 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 STOML3Q8TAV4 291 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 GPR132Q9UNW8 380 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ABCD4O14678 606 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 CA11O75493 328 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 AKR1C4P17516 323 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 C10orf35Q96D05 121 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 GPER1Q99527 375 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ESPL1Q14674 2120 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 FAM25EA8MYX2 175 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 CA6P23280 308 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TAS2R46P59540 309 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 KCTD9Q7L273 389 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 TMEM104Q8NE00 496 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 RAB18Q9NP72 206 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 C5orf51A6NDU8 294 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 J3QW42 95 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 LGALS8O00214 317 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SOCS1O15524 211 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SFT2D2O95562 160 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 BTN1A1Q13410 526 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 MBD2Q9UBB5 411 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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CAPN3-209ENST00000466222 F8VWA3 439 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TEX46H3BTG2 121 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 PLATP00750 562 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 RNF224P0DH78 156 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SERPINF1P36955 418 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM50BP56557 158 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 DUSP13Q9UII6 198 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 RAB19A4D1S5 217 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 RAC2P15153 192 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 MTCP1P56278 107 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ARFRP1Q13795 201 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF273Q14593 569 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 SLC22A25Q6T423 547 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 OPA3Q9H6K4 179 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPN3-209ENST00000466222 NUDT19A8MXV4 375 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 H0YL77 283 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 SIAH2O43255 324 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 CLDN14O95500 239 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 NAT2P11245 290 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 LYL1P12980 280 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPN3-209ENST00000466222 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
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