RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 PNLIPRP2P54317 469 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 RIGQ13278 110 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TOR2AQ5JU69 321 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF383Q8NA42 475 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TAAR6Q96RI8 345 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PDFQ9HBH1 243 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SCN4AP35499 1836 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 FMODQ06828 376 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.42e-6■■■□□ 17.1
SPTA1-201ENST00000368147 LEMD1Q68G75 181 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 C4orf45Q96LM5 186 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 NID1P14543 1247 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 LIFP15018 202 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 LIPAP38571 399 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF415Q09FC8 603 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TNXAQ16473 311 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 CLDN23Q96B33 292 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 GSX2Q9BZM3 304 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ASB1Q9Y576 335 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HSPB2A8KAH6 182 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 FCGR3BO75015 233 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ERVS71-1P61550 626 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HSPB2Q16082 182 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ACACAQ13085 2346 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 K7ESF4 209 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 FCN1O00602 326 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PAPLNO95428 1278 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 GYPAP02724 150 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MGMTP16455 207 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 LGALS7P47929 136 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 Q8WTZ3 238 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 AKR7A2O43488 359 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ALX3O95076 343 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 IGKV3-15P01624 115 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 BTG1P62324 171 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OSR2Q8N2R0 312 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 RAB1CQ92928 201 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MANBALQ9NQG1 85 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PSENENQ9NZ42 101 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 NAT8Q9UHE5 227 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SP9P0CG40 484 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 NQO2P16083 231 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 GABRA6Q16445 453 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 ASCL4Q6XD76 172 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 POM121Q96HA1 1249 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 A0A087WV62 115 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRX2 142 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 PRR19A6NJB7 356 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM262E9PQX1 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 HRASP01112 189 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 KRASP01116 189 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 NMUP48645 174 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 GZMKP49863 264 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 LYZP61626 148 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 SERF2P84101 59 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 AMER3Q8N944 861 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.29□□□□□ -1.4
SPTA1-201ENST00000368147 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms