RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 IFNA21P01568 189 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ACSM4P0C7M7 580 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ALOX5APP20292 161 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM230Q96A57 120 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 DEFA3P59666 94 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYND11Q15326 602 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 C10orf128Q5T292 105 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM165Q9HC07 324 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 J3QLI3 93 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 UBBP0CG47 229 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GABRB1P18505 474 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 MIDNQ504T8 468 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DGUOKQ16854 277 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.74□□□□□ -1.81
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