RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TMEM187Q14656 261 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 RAB35Q15286 201 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 EXT1Q16394 746 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HFEQ30201 348 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 GAPTQ8N292 157 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 A6NLC8 198 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 TBPP20226 339 aa7.46□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 OR2T2Q6IF00 324 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 EXTL1Q92935 676 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 TM2D1Q9BX74 207 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 NAA60Q9H7X0 242 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 TMEM100Q9NV29 134 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 LINC01387J3KSC0 135 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 TMEM50AO95807 157 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 PRDX4Q13162 271 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 SMCO1Q147U7 214 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HERPUD1Q15011 391 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 DHRS13Q6UX07 377 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 SGCZQ96LD1 299 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PPH5 198 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 OR6C6A6NF89 314 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS1-201ENST00000262460 FOXO1Q12778 655 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 MALLQ13021 153 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HAGHQ16775 308 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 KIRREL1Q96J84 757 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 GUCD1Q96NT3 240 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 WDR54Q9H977 334 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 MMP26Q9NRE1 261 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 LRBAP50851 2863 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 A0A0G2JRQ6 117 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 C9orf172C9J069 976 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN15O95858 294 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 PPYP01298 95 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 CTSSP25774 331 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 CAMLGP49069 296 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HERV-K104P61576 105 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H3AP68431 136 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 PPA1Q15181 289 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 ACTBL2Q562R1 376 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GW55 424 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS1-201ENST00000262460 IGSF23A1L1A6 192 aa7.44□□□□□ -1.22
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