RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF221Q9UK13 617 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 MEMO1Q9Y316 297 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM82A0PJX8 343 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 C19orf84I3L1E1 186 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 PEX14O75381 377 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR4A8P0C604 315 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CD80P33681 288 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 H2BFSP57053 126 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R19P59542 299 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC29Q8WV35 223 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 THRSPQ92748 146 aa5.56□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR2H2O95918 312 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 HOXB5P09067 269 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FCGR2CP31995 323 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 NRN1LQ496H8 165 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 KIRREL1Q96J84 757 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ETAA1Q9NY74 926 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 NDUFB6O95139 128 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR5H8P0DN80 308 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CD37P11049 281 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 COL8A1P27658 744 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GLIPR1P48060 266 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 EDDM3BP56851 147 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR8G5Q8NG78 346 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RGCCQ9H4X1 137 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 DEGS1O15121 323 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV1-44P01699 117 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CHRM2P08172 466 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FCGR3AP08637 254 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SSTR5P35346 364 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ACTBP60709 375 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ACTG1P63261 375 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ZFP69Q49AA0 526 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 WDR82Q6UXN9 313 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 NRGNQ92686 78 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 HSPB11Q9Y547 144 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GOSR2O14653 212 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CTDSPLO15194 276 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 PDCD6O75340 191 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CSF1P09603 554 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 COX5BP10606 129 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RAC2P15153 192 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FUT3P21217 361 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 UCNP55089 124 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 DHRS2Q13268 280 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 DYRK1AQ13627 763 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.55□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 OR4E1P0C645 316 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RBPJQ06330 500 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 HERPUD1Q15011 391 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 ADIPOQQ15848 244 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 KIF25Q9UIL4 384 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CST4P01036 141 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 RAB6AP20340 208 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CA7P43166 264 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 IL13RA1P78552 427 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 CDH24Q86UP0 819 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.54□□□□□ -1.52
CNIH1-201ENST00000216416 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms