RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	RUNX1	Q01196	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	GUK1	Q16774	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449		E5RGE8	158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	PRDX4	Q13162	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	DEGS1	O15121	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CELA3A	P09093	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NQO2	P16083	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SELE	P16581	610 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	BCL3	P20749	454 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	GABRA2	P47869	451 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	FABP6	P51161	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RAC3	P60763	192 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NAA60	Q9H7X0	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	F2RL1	P55085	397 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6C6	A6NF89	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CRYBA1	P05813	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IFI6	P09912	130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CHAT	P28329	748 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NDUFA6	P56556	154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RHEB	Q15382	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	PDCD6	O75340	191 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SPP1	P10451	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CALCR	P30988	508 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	FUT6	P51993	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IL11RA	Q14626	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR1C1	Q15619	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LYZL4	Q96KX0	146 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	MMP26	Q9NRE1	261 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PPH5	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	MFNG	O00587	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	LYZL6	O75951	148 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CST4	P01036	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NMES1	Q9C002	83 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NGF	P01138	241 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SCT	P09683	121 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	GAPT	Q8N292	157 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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