RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 RASL12Q9NYN1 266 aa14.53□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 ZNF222Q9UK12 451 aa14.53□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 NPTNQ9Y639 398 aa14.53□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.53□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 PDCD6O75340 191 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 SCGNO76038 276 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 TPPPO94811 219 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 PHF21AQ96BD5 680 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 POM121Q96HA1 1249 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 NLKQ9UBE8 527 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 HSF4Q9ULV5 492 aa14.52□□□□□ -0.08
LGMN-216ENST00000557434 POLQO75417 2590 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 PSPNO60542 156 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 HAND1O96004 215 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 KNG1P01042 644 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 CD3GP09693 182 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 IL7P13232 177 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 FUT3P21217 361 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SCN1BQ07699 218 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 FAM189A2Q15884 450 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 LINC00596Q86U02 117 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 GPX8Q8TED1 209 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 KLK11Q9UBX7 282 aa14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 A0A1B0GW55 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 OR2AT4A6NND4 320 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 HSPB6O14558 160 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 UPK1BO75841 260 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 HACD4Q5VWC8 232 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 STUMQ69YW2 141 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 RDH5Q92781 318 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 BORCS5Q969J3 196 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DUX4Q9UBX2 424 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 AK3Q9UIJ7 227 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.51□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 GABARAPH6UMI1 98 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SIRPB1O00241 398 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 LMO1P25800 156 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 PITPNAQ00169 270 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 STEAP3Q658P3 488 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 CCDC32Q9BV29 185 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ARID1AO14497 2285 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 TMEM82A0PJX8 343 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 UBE2QL1A1L167 161 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 OOEPA6NGQ2 149 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DEGS1O15121 323 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 FCN3O75636 299 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SELLP14151 372 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 PRSS3P35030 304 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 HPS1Q92902 700 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.5□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 A0A1W2PQ09 198 aa14.49□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 LRRC30A6NM36 301 aa14.49□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 SH2D1BO14796 132 aa14.49□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ORC5O43913 435 aa14.49□□□□□ -0.09
LGMN-216ENST00000557434 ZNF737O75373 536 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms