RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 TOX4O94842 621 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 HTR3BO95264 441 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 TNFAIP8O95379 198 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR2H2O95918 312 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PSMB9P28065 219 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 SCGB2A2Q13296 93 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GPR176Q14439 515 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR8H2Q8N162 312 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 MUL1Q969V5 352 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1W2PQ09 198 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 DEGS1O15121 323 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PSPNO60542 156 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GALP22466 123 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GABRR1P24046 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 IL13RA2Q14627 380 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OSR2Q8N2R0 312 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 CHST4Q8NCG5 386 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 TBX15Q96SF7 602 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 NUP50Q9UKX7 468 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 A0A0G2JK05 382 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 M0R1W7 72 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 SIRPB1O00241 398 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF44P15621 663 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 EPHA1P21709 976 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 SCN1BQ07699 218 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 PDCD1Q15116 288 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GRK1Q15835 563 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 Q8N7P7 452 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 GHRLQ9UBU3 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM4-202ENST00000476842 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.65□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 A0A087WXM4 84 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1W2PPH5 198 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 MGST3O14880 152 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 GTF2F2P13984 249 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 FPR2P25090 351 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 OR3A1P47881 315 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 BPIFB3P59826 476 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 AWAT2Q6E213 333 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 CHST6Q9GZX3 395 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 SERPINA2P20848 420 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 EDDM3BP56851 147 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 BLMHQ13867 455 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 PIGYQ3MUY2 71 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 LINC00596Q86U02 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 IFT22Q9H7X7 185 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 JMJD1CQ15652 2540 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1W2PP11 408 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 SLC22A1O15245 554 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 CSN2P05814 226 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 UBBP0CG47 229 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 PRTN3P24158 256 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 PSMD7P51665 324 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 NEDD8Q15843 81 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM4-202ENST00000476842 GPR157Q5UAW9 335 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.1 ms