RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV2-5P01817 119 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEXAP06865 529 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WNT2P09544 360 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBBP0CG47 229 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSG2P11465 335 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AMY2BP19961 511 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB3BP20337 219 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCL3P20749 454 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPBWR2P48146 333 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF12P61328 243 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR176Q14439 515 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RSU1Q15404 277 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTF1Q16619 201 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB39BQ96DA2 213 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEH1LQ96EE3 360 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SDSLQ96GA7 329 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C18orf12Q96KH6 178 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 S100A13Q99584 98 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC32Q9BV29 185 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPA2Q9H2U2 334 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTSZQ9UBR2 303 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MIOXQ9UGB7 285 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0G2JK05 382 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00862A6NCI5 91 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMX3A6NHT5 357 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A8MXK9 166 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AIPO00170 330 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIGLEC5O15389 551 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM127O75204 238 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GYPAP02724 150 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GTF2F2P13984 249 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HTR2CP28335 458 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL2RGP31785 369 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRDX2P32119 198 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SDC2P34741 201 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAPZA1P52907 286 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10A3P58181 314 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GMFBP60983 142 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 QRFPP83859 136 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL13RA2Q14627 380 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB11BQ15907 218 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AWAT2Q6E213 333 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00596Q86U02 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOXA1Q86UR1 476 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OSR2Q8N2R0 312 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF561Q8N587 486 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD177Q8N6Q3 437 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHST4Q8NCG5 386 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A28Q96A46 364 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POM121Q96HA1 1249 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GAFA1Q96PS6 74 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR8B2Q96RD0 313 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCL13Q99616 98 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ING4Q9UNL4 249 aa6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms