RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.5□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.5□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.5□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 GABRPO00591 440 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MYL12AP19105 171 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 LMO1P25800 156 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 GPR148Q8TDV2 347 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 NEK6Q9HC98 313 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.49□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MEGF11A6BM72 1044 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 POM121CA8CG34 1229 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MGST3O14880 152 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PAHP00439 452 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 CRYBA1P05813 215 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM225BP0DP42 221 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 RAB3AP20336 220 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM106AQ96A25 262 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF714Q96N38 554 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 RHOFQ9HBH0 211 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.48□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ODF3BA8MYP8 253 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 H3BUX3 64 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SH2D1BO14796 132 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MMP23AO75900 390 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 RBP4P02753 201 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 P2RX3P56373 397 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 KRTAP10-3P60369 221 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC34A1Q06495 639 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ASCL4Q6XD76 172 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 Q6ZSV7 163 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PXT1Q8NFP0 134 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 OR4F5Q8NH21 305 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 GHSRQ92847 366 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.47□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A0G2JK05 382 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A1W2PPE2 198 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A1W2PR64 198 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A1W2PRV1 198 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 hADV38S2A0JD32 116 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ALDOBP05062 364 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 ELP2Q6IA86 826 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 AHSA2Q719I0 299 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SATL1Q86VE3 508 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 Q8NFD4 153 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 LINC01006Q8NI28 216 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PIFOQ8TCI5 191 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 COQ2Q96H96 371 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SSX3Q99909 188 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 SLITRK2Q9H156 845 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 PPA2Q9H2U2 334 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 BEX1Q9HBH7 125 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 GLS2Q9UI32 602 aa14.46□□□□□ -0.09
SBDSP1-202ENST00000423945 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 CD2P06729 351 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF44P15621 663 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 OR3A4PP47883 348 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 GLIPR1P48060 266 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 MTNR1BP49286 362 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 AQP4P55087 323 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 SCN1BQ07699 218 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF626Q68DY1 528 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.45□□□□□ -0.1
SBDSP1-202ENST00000423945 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms