RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 IL13RA1P78552 427 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 Q6P435 159 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 FAM89BQ8N5H3 189 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 OR56B1Q8NGI3 324 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NICN1Q9BSH3 213 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SPACA1Q9HBV2 294 aa23.18■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SCGNO76038 276 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RPS2P15880 293 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 COL10A1Q03692 680 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PDCD1Q15116 288 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NLRC3Q7RTR2 1065 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A38Q96DW6 304 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 Q96MF0 132 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 GAFA1Q96PS6 74 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 A3GALT2U3KPV4 340 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC5O15389 551 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 AMY2BP19961 511 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 LMO1P25800 156 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PITPNBP48739 271 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RAB40AQ8WXH6 277 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PHF21AQ96BD5 680 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ABCG5Q9H222 651 aa23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SIRPB1O00241 398 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 TFF1P04155 84 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 VEGFCP49767 419 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 LYPD2Q6UXB3 125 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 OR8B3Q8NGG8 313 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 OR8B2Q96RD0 313 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 MMP27Q9H306 513 aa23.16■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RGS5O15539 181 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ATAD3CQ5T2N8 411 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 FAM216BQ8N7L0 139 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CLDND2Q8NHS1 167 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R35Q8TAP8 253 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RAB39BQ96DA2 213 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NEDD4LQ96PU5 975 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 MAB21L2Q9Y586 359 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NOTCH2Q04721 2471 aa23.15■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0A6YYD4 124 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 APOA1P02647 267 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 HEXAP06865 529 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RAB12Q6IQ22 244 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ZNRF1Q8ND25 227 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SNX22Q96L94 193 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 METRNQ9UJH8 293 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC168Q8NDH2 2452 aa23.14■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 HPGDSO60760 199 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 WNT2P09544 360 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 FUT3P21217 361 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 USF1P22415 310 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 FAM234AQ9H0X4 552 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM30Q9UKF2 790 aa23.14■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFB3O43676 98 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 PDCD6O75340 191 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV2-5P01817 119 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC10Q5BKY1 277 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 SIGIRRQ6IA17 410 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 CMTM4Q8IZR5 234 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM185AQ8NFB2 350 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 OR10R2Q8NGX6 335 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 DIABLOQ9NR28 239 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF581Q9P0T4 197 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 CTSZQ9UBR2 303 aa23.13■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0A6YYH2 397 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 TRAV24A0A0B4J272 114 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 A6NJ64 397 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 F5H0A9 414 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 CTDSP2O14595 271 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 SOCS1O15524 211 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF737O75373 536 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 BIVMQ86UB2 503 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 SUMF2Q8NBJ7 301 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 WFDC11Q8NEX6 87 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 OR5D13Q8NGL4 314 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 PEX16Q9Y5Y5 336 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 CSMD1Q96PZ7 3565 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GW55 424 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 K7N7A8 449 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 RAB27BO00194 218 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 PSPNO60542 156 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 DUX4L2P0CJ85 424 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 DUX4L3P0CJ86 424 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 DUX4L4P0CJ87 422 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-201ENST00000345425 DUX4L5P0CJ88 424 aa23.12■■□□□ 1.29
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