RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 Q8TCH9 128 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCL17Q92583 94 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAB3CQ96E17 227 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C14orf79Q96F83 325 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TM2D1Q9BX74 207 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DLL4Q9NR61 685 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.21□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FLNCQ14315 2725 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SRRM5B3KS81 715 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 H7C417 338 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DEGS1O15121 323 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD40LGP29965 261 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 INPP1P49441 399 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPP5CP53041 499 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ERVK11-1P61568 191 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SCN1BQ07699 218 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IKZF1Q13422 519 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IL13RA2Q14627 380 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KCNJ8Q15842 424 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MICBQ29980 383 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PIGYQ3MUY2 71 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NEK7Q8TDX7 302 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 Q96M66 194 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF488Q96MN9 340 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCL19Q99731 98 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A0G2JMP0 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A0X1KG70 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A1W2PPR1 153 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAB27BO00194 218 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KNG1P01042 644 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD8AP01732 235 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF44P15621 663 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FUT3P21217 361 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TAS2R20P59543 309 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLA2G7Q13093 441 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CDNFQ49AH0 187 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C16orf87Q6PH81 154 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR8H2Q8N162 312 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DTX3Q8N9I9 347 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RDH5Q92781 318 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TIMD4Q96H15 378 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NICN1Q9BSH3 213 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCDC32Q9BV29 185 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HES4Q9HCC6 221 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TREM2Q9NZC2 230 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NLKQ9UBE8 527 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 V9GYH0 126 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ABCA4P78363 2273 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SERPINE3A8MV23 424 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPIAL4DF5H284 164 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 F8VVB4 439 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 F8VWA3 439 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SOCS1O15524 211 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PDCD6O75340 191 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LHBP01229 141 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HPXP02790 462 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRSS3P35030 304 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GNG2P59768 71 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MADCAM1Q13477 382 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ARFRP1Q13795 201 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF146Q15072 292 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPRNQ5BIV9 151 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms