RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	C17orf50	Q8WW18	174 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX22	Q96L94	193 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SSX3	Q99909	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLS2	Q9UI32	602 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFA7	O95182	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGHA1	P01876	353 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	HCK	P08631	526 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PEX2	P28328	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	BMX	P51813	675 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCN1B	Q07699	218 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRK1	Q15835	563 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	LY6E	Q16553	131 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989		Q8IYB0	196 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RYR3	Q15413	4870 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989		H3BUX3	64 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIRPB1	O00241	398 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF737	O75373	536 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFPL1	O95159	310 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC159	P0C7I6	412 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989		Q6ZSV7	163 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SH2D1B	O14796	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARG1	P05089	322 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM225B	P0DP42	221 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TGFBR2	P37173	567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SOX2	P48431	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLX6	P56179	175 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RCN1	Q15293	331 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF691	Q5VV52	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	LINC01006	Q8NI28	216 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	HMG20A	Q9NP66	347 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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