RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SNX22Q96L94 193 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 CITED1Q99966 193 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 ZNF728P0DKX0 622 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 TGFBR2P37173 567 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 PROK1P58294 105 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 GRK1Q15835 563 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 Q8IYB0 196 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 OR8H2Q8N162 312 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 Q96MT0 163 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 OPALINQ96PE5 141 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 NEK6Q9HC98 313 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 C17orf98A8MV24 154 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SIRPB1O00241 398 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 MPZL2O60487 215 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 PSPNO60542 156 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 IGKV1D-12P01611 117 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 ARG1P05089 322 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 PDZK1IP1Q13113 114 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SLC35E4Q6ICL7 350 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 TCF23Q7RTU1 214 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SYS1Q8N2H4 156 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 APH1BQ8WW43 257 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SPSB1Q96BD6 273 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 ZNF649Q9BS31 505 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 C16orf95Q9H693 158 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-203ENST00000587752 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TSPAN9O75954 239 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 CLPXO76031 633 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZFPL1O95159 310 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 PEX2P28328 305 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 LPCAT4Q643R3 524 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZNF714Q96N38 554 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 HMG20AQ9NP66 347 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 hADV38S2A0JD32 116 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 WIPF1O43516 503 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 CLIC3O95833 236 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 HCKP08631 526 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 GABRA5P31644 462 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 OR3A1P47881 315 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 RAB13P51153 203 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SCN1BQ07699 218 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 RAB40BQ12829 278 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZNF146Q15072 292 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 FAM189A2Q15884 450 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 OR5AK2Q8NH90 309 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 STMN2Q93045 179 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 COMMD4Q9H0A8 199 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ING3Q9NXR8 418 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 GLS2Q9UI32 602 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TMEM212A6NML5 194 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 M0QZ24 198 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SH2D1BO14796 132 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 MGST3O14880 152 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TIMM23O14925 209 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 KDM4BO94953 1096 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 OR2H2O95918 312 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 MT-ND2P03891 347 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 LIMS3P0CW19 117 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 LIMS4P0CW20 117 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 TMEM225BP0DP42 221 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SOX2P48431 317 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SSX2Q16385 188 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 ZSCAN26Q16670 478 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-203ENST00000587752 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms