RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 SGCDQ92629 289 aa15.65■□□□□ 0.1
EDC3-211ENST00000566243 TMEM106AQ96A25 262 aa15.65■□□□□ 0.1
EDC3-211ENST00000566243 ORAI1Q96D31 301 aa15.65■□□□□ 0.1
EDC3-211ENST00000566243 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.65■□□□□ 0.1
EDC3-211ENST00000566243 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MYL12BO14950 172 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 KDM4BO94953 1096 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 HAND1O96004 215 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CDK1P06493 297 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RAB3AP20336 220 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PRTN3P24158 256 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 KLRD1Q13241 179 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 NEK6Q9HC98 313 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 HMG20AQ9NP66 347 aa15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PTGES3LE9PB15 166 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CD2P06729 351 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MYF6P23409 242 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 WNT4P56705 351 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ZNF273Q14593 569 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ZNF146Q15072 292 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 VCX3BQ9H321 246 aa15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 A0A0U1RQK1 487 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 GABRPO00591 440 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PSPNO60542 156 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ATP6V1G2O95670 118 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TMEM225BP0DP42 221 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CCL3L1P16619 93 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TAS2R43P59537 309 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PNKDQ8N490 385 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SNX22Q96L94 193 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ERGIC3Q9Y282 383 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ANK2Q01484 3957 aa15.62■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PRD5 423 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PRF3 423 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PRM7 423 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CLDN34H7C241 214 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ERVFRD-1P60508 538 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ACTG1P63261 375 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RIPK1Q13546 671 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 BLMHQ13867 455 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 Q499Y3 187 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RNLSQ5VYX0 342 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 HCP5Q6MZN7 132 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SATL1Q86VE3 508 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 OR8H2Q8N162 312 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ZDHHC16Q969W1 377 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CHST6Q9GZX3 395 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SCN3BQ9NY72 215 aa15.61■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SIRPB1O00241 398 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MAGEB3O15480 346 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 ALDOBP05062 364 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MELTFP08582 738 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 CELP19835 753 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 GABRR1P24046 479 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 EDDM3BP56851 147 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 SLC35A2P78381 396 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 Q6YL49 198 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TCF23Q7RTU1 214 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 MYDGFQ969H8 173 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 OR14A2Q96R54 314 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 RHOFQ9HBH0 211 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 NOX4Q9NPH5 578 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.6■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.59■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.59■□□□□ 0.09
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PPK0 400 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms