RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 F8VVB4 439 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 F8VWA3 439 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 SH2D1BO14796 132 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 INMTO95050 263 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMD7P51665 324 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF12P61328 243 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 FABP5Q01469 135 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PAX2Q02962 417 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 INSL4Q14641 139 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CD177Q8N6Q3 437 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 Q8NFD4 153 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R35Q8TAP8 253 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 BEX2Q9BXY8 128 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 GHRLQ9UBU3 117 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MAB21L2Q9Y586 359 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CRLF1O75462 422 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 HAND1O96004 215 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CSTBP04080 98 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 SFTPBP07988 381 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIAL4GP0DN37 164 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 OR3A4PP47883 348 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DGUOKQ16854 277 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF144BQ7Z419 303 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 BATF2Q8N1L9 274 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CHST4Q8NCG5 386 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D15Q8TC07 691 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MMP26Q9NRE1 261 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 ING4Q9UNL4 249 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPZA1P52907 286 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 SCGB2A2Q13296 93 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 NEDD8Q15843 81 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM27D1Q5T7N8 215 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNRF1Q8ND25 227 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEA13PA6NCF6 341 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 UBBP0CG47 229 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFB7P17568 137 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 COL10A1Q03692 680 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PAX8Q06710 450 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 IL13RA2Q14627 380 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00596Q86U02 117 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRTM1Q86UE6 522 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51T1Q8NGJ9 327 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 C8orf46Q8TAG6 207 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX22Q96L94 193 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 AUP1Q9Y679 476 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1B0GW55 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 C22orf46C9J442 243 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 K7N7A8 449 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TK1P04183 234 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 NHLRC3Q5JS37 347 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 LYPD6Q86Y78 171 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MUL1Q969V5 352 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX4Q9UBX2 424 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 STUB1Q9UNE7 303 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPH5 198 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PDCD5O14737 125 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 HTR3BO95264 441 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CD37P11049 281 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 MYL9P24844 172 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 AWAT2Q6E213 333 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 CMTM4Q8IZR5 234 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 LY6G5BQ8NDX9 201 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 SSR3Q9UNL2 185 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 FN1P02751 2386 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-212ENST00000508338 CDRT1O95170 752 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2F2P13984 249 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms