RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SMIM19Q96E16 107 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM82A0PJX8 343 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 H0YHG0 523 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 K7N7A8 449 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 M0R1W7 72 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHRM2P08172 466 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM225BP0DP42 221 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCL3L1P16619 93 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RAB3AP20336 220 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GABRR1P24046 479 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BPIFB3P59826 476 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ERVFRD-1P60508 538 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZP1P60852 638 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF273Q14593 569 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KISS1Q15726 138 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SATL1Q86VE3 508 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SGCDQ92629 289 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GHSRQ92847 366 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TNFRSF14Q92956 283 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM106AQ96A25 262 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHST6Q9GZX3 395 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HMG20AQ9NP66 347 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FKBP14Q9NWM8 211 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTGES3LE9PB15 166 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 H0YJX3 145 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SIRPB1O00241 398 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYL12BO14950 172 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PSPNO60542 156 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KDM4BO94953 1096 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EDDM3BP56851 147 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BLMHQ13867 455 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EDDM3AQ14507 147 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF529Q6P280 563 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TPRX1Q8N7U7 411 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC25A28Q96A46 364 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM234AQ9H0X4 552 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GABRPO00591 440 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NPFFO15130 113 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALX3O95076 343 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CD2P06729 351 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MELTFP08582 738 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WNT4P56705 351 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCN1BQ07699 218 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF146Q15072 292 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GRK1Q15835 563 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HCP5Q6MZN7 132 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 Q6YL49 198 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR8H2Q8N162 312 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SNX22Q96L94 193 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GPER1Q99527 375 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.87□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A1W2PPK0 400 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM89A2RUT3 159 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CLDN34H7C241 214 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAGEB3O15480 346 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR2H2O95918 312 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IGHV4-59P01825 116 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDK1P06493 297 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CELP19835 753 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SAA4P35542 130 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR3A1P47881 315 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR3A4PP47883 348 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBE2E1P51965 193 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DLX6P56179 175 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TAS2R43P59537 309 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPP3R1P63098 170 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GUCA2AQ02747 115 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.86□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms