RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 COX4I1P13073 169 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF823P16415 610 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SLC6A6P31641 620 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HIST1H3AP68431 136 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 COX10Q12887 443 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR8G1Q15617 311 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF404Q494X3 552 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 PGAP1Q75T13 922 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 FAM122BQ7Z309 247 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM86BQ8N661 226 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SLC7A6Q92536 515 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SGCDQ92629 289 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SPTSSAQ969W0 71 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 RCN3Q96D15 328 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 CMTM6Q9NX76 183 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 B9D1Q9UPM9 204 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TENM3Q9P273 2699 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1B0GWJ7 208 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GGT3PA6NGU5 568 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SRRM5B3KS81 715 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF879B4DU55 563 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 H0YL77 283 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 LGALS8O00214 317 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 NME4O00746 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MLNRO43193 412 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ADAM20O43506 726 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR10H3O60404 316 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 NDUFA7O95182 113 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HLA-DPB1P04440 258 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ACSM4P0C7M7 580 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OMGP23515 440 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GGT2P36268 569 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 DDOSTP39656 456 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 CD200P41217 278 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GSK3BP49841 420 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 ERFP50548 548 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 NUDT2P50583 147 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 RAG2P55895 527 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 PSME3P61289 254 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 FGF12P61328 243 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 DEFA6Q01524 100 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 PAX2Q02962 417 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GAGE2BQ13066 116 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2V1Q13404 147 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TAF13Q15543 124 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR8B8Q15620 311 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 SNCBQ16143 134 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MEP1BQ16820 701 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 RFX4Q33E94 735 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GAGE2EQ4V326 116 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GLYATQ6IB77 296 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 CORO6Q6QEF8 472 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00471Q8N535 108 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR4K13Q8NH42 304 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 OR52J3Q8NH60 311 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-204ENST00000367379 FANK1Q8TC84 345 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms