RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CCL19Q99731 98 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SSR3Q9UNL2 185 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PLSCR5A0PG75 271 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR5B21A6NL26 309 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SERPINA3P01011 423 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ALDOBP05062 364 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CD2P06729 351 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 HCKP08631 526 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PGA5P0DJD9 388 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PAX1P15863 534 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 IL2RGP31785 369 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PTH2RP49190 550 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 FUT6P51993 359 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MTCP1P56278 107 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 GNG3P63215 75 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PDCD1Q15116 288 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PIGYQ3MUY2 71 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 FAM168AQ92567 244 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SPSB1Q96BD6 273 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PERPQ96FX8 193 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 KCTD7Q96MP8 289 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 NICN1Q9BSH3 213 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 HES4Q9HCC6 221 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 IL19Q9UHD0 177 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MAST4O15021 2626 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 NOTCH2Q04721 2471 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 LRP5LA4QPB2 252 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 IFITM5A6NNB3 132 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SRRM5B3KS81 715 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 J3QT63 122 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SLC17A2O00624 439 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ARL6IP5O75915 188 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 KDM4BO94953 1096 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF12P17014 697 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 RAB3BP20337 219 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP1P28562 367 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 PTGFRP43088 359 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 RBP2P50120 134 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 MADCAM1Q13477 382 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 RIN1Q13671 783 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 ZMYND11Q15326 602 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 AVPI1Q5T686 147 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 Q8N3U1 123 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 CD177Q8N6Q3 437 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 DTX3Q8N9I9 347 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 OR8S1Q8NH09 359 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 Q8TCH9 128 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC29Q8WV35 223 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 FAM46BQ96A09 425 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 BORCS8Q96FH0 119 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-211ENST00000561438 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms