RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NOX3	Q9HBY0	568 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	BATF3	Q9NR55	127 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CENPM	Q9NSP4	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SPTA1	P02549	2419 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CACNA1C	Q13936	2221 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NBAS	A2RRP1	2371 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPW3	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CIB4	A0PJX0	185 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C5orf63	A6NC05	138 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		J3QLW9	94 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CCL24	O00175	119 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RAB36	O95755	333 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PNP	P00491	289 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CST2	P09228	141 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF19	P17023	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MYL12A	P19105	171 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NPR2	P20594	1047 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	COX5A	P20674	150 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CAPZA1	P52907	286 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MTCP1	P56278	107 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GALK2	Q01415	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SPHAR	Q15513	63 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	STK11	Q15831	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NEDD8	Q15843	81 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC7A6	Q92536	515 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RORB	Q92753	470 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF75A	Q96N20	296 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf198	Q9H425	327 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WW49	117 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM129	A0AVI4	362 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR5H1	A6NKK0	313 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		F5H5K5	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		H3BSA7	217 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SULT1C4	O75897	302 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KRT8	P05787	483 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CD79A	P11912	226 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CCL2	P13500	99 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CBR1	P16152	277 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms