RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MYL12AP19105 171 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 AMY2BP19961 511 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GABRA2P47869 451 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 AHSA2Q719I0 299 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ZNF573Q86YE8 665 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CALHM1Q8IU99 346 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 JAM3Q9BX67 310 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OPN4Q9UHM6 478 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 HHLA2Q9UM44 414 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PTGES3LE9PB15 166 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 H0YJX3 145 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 J3QLI3 93 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 DVL1O14640 695 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ATP6V1G2O95670 118 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LALBAP00709 142 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SELLP14151 372 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ATF1P18846 271 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GATA3P23771 443 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CPT2P23786 658 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TGM4P49221 684 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FUT6P51993 359 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PAX2Q02962 417 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 IKZF1Q13422 519 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 STX19Q8N4C7 294 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ST8SIA4Q92187 359 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 BORCS8Q96FH0 119 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 JMJD8Q96S16 334 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CHST5Q9GZS9 411 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 NLKQ9UBE8 527 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 AUP1Q9Y679 476 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.96□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MEGF11A6BM72 1044 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TMEM212A6NML5 194 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR2AT4A6NND4 320 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 C22orf46C9J442 243 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 J3QT63 122 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OGG1O15527 345 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NDUFB3O43676 98 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CCDC159P0C7I6 412 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OCM2P0CE71 109 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PSG2P11465 335 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SOX2P48431 317 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NPY4RP50391 375 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MTCP1P56278 107 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PAX8Q06710 450 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MED21Q13503 144 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RIPK1Q13546 671 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 STUMQ69YW2 141 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 USP43Q70EL4 1123 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RNF144BQ7Z419 303 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 POC1AQ8NBT0 407 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NANPQ8TBE9 248 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PP6455Q8WZ26 134 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SGCDQ92629 289 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SLAMF9Q96A28 289 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RFT1Q96AA3 541 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms