RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRT1	Q99946	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MED28	Q9H204	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		G3V3Q6	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SOCS1	O15524	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CGA	P01215	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-H	P01893	362 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TPO	P07202	933 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-G	P17693	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DTYMK	P23919	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	WNT5A	P41221	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RAD52	P43351	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP1B3	P54709	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MTCP1	P56278	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IFITM2	Q01629	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRA6	Q16445	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZS49	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	WBP1	Q96G27	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GPER1	Q99527	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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