RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF35P13682 527 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PI3P19957 117 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TBPP20226 339 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OPRM1P35372 400 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 H2BFSP57053 126 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 RAP2BP61225 183 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 BAMBIQ13145 260 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R1AQ13522 171 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFBP7Q16270 282 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 ASCL4Q6XD76 172 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZT83 130 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TERB2Q8NHR7 220 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TECTBQ96PL2 329 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GON7Q9BXV9 100 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH20Q9HBT6 801 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 AK3Q9UIJ7 227 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C1Q12789 2109 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 AHRRA9YTQ3 701 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 G3V3Q6 166 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2A4O95047 310 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CD33P20138 364 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 CA6P23280 308 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 COL8A1P27658 744 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CD34P28906 385 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF81P51508 661 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 IL13RA1P78552 427 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYND11Q15326 602 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTBL2Q562R1 376 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZS92 163 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 KCTD9Q7L273 389 aa3.42□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM17Q86X19 198 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLAMF9Q96A28 289 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF75AQ96N20 296 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2A7Q96R45 310 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MICU1Q9BPX6 476 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PPA2Q9H2U2 334 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 DKK4Q9UBT3 224 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.41□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PROB1E7EW31 1015 aa3.41□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCSO14618 274 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF205O95201 554 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CST4P01036 141 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB25P24278 435 aa3.41□□□□□ -1.86
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LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP1P28562 367 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC12P31275 282 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R46P59540 309 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ARPC4P59998 168 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVS71-1P61550 626 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL6Q6ICC9 239 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2A2Q6IF42 318 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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