RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 WDR54Q9H977 334 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NMUR1Q9HB89 426 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP13Q12802 2813 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD300LBA8K4G0 201 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 B4DXG7 233 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ANHXE9PGG2 379 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM262E9PQX1 116 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf98E9PRG8 122 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BCKDKO14874 412 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PI15O43692 258 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IGSF6O95976 241 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ATP1B1P05026 303 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-EP13747 358 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RAB5AP20339 215 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CERS1P27544 350 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CRABP2P29373 138 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SSR2P43308 183 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 EFNA3P52797 238 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN12P56749 244 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RIPPLY3P57055 190 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HERVK_113P61574 105 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PSPHP78330 225 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SELENBP1Q13228 472 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP7Q16829 419 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CXCL17Q6UXB2 119 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TM9SF4Q92544 642 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BTN2A3PQ96KV6 586 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C8orf49Q96NF6 230 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRAP1Q96NZ9 151 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PITX2Q99697 317 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CST11Q9H112 138 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GIN1Q9NXP7 522 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KLRF1Q9NZS2 232 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR1A2Q9Y585 309 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 V9GYY9 64 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CACNA1HO95180 2353 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RYR3Q15413 4870 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0U1RQV1 116 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRP5LA4QPB2 252 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCL22O00626 93 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACOX3O15254 700 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CYB5BO43169 146 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF623O75123 536 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C1QL1O75973 258 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR2J3O76001 311 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK2O95069 426 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GABARAPO95166 117 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SNAPINO95295 136 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 M6PRP20645 277 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AADACP22760 399 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HTR2CP28335 458 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GABRR2P28476 465 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CD34P28906 385 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CALCRP30988 508 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 XCR1P46094 333 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DAP3P51398 398 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCR6P51684 374 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RAB8AP61006 207 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PMS2P3Q13401 168 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 COQ5Q5HYK3 327 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR5M10Q6IEU7 315 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TBPL2Q6SJ96 375 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 METTL7BQ6UX53 244 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GFRALQ6UXV0 394 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DEFB132Q7Z7B7 95 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms