RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 RSU1Q15404 277 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 HAGHQ16775 308 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 GFI1BQ5VTD9 330 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 OR52M1Q8NGK5 317 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGT1Q9H0U3 335 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF224P0DH78 156 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SSC4DQ8WTU2 575 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ANXA10Q9UJ72 324 aa15□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SVILO95425 2214 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SERPINE3A8MV23 424 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 PRF1P14222 555 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TAAR5O14804 337 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 JTBO76095 146 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 OR8U8P0C7N1 319 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CCL1P22362 96 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM156Q8N614 296 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.99□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 GUK1Q16774 197 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 GJC3Q8NFK1 279 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 HAS2Q92819 552 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 PARP11Q9NR21 331 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 AQP7P3A6NL99 342 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM157AC9JC47 383 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF728P0DKX0 622 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 GUSBP11Q6P575 273 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CHST5Q9GZS9 411 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 C5orf52A6NGY3 159 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ONECUT2O95948 504 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CCL20P78556 96 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 HGFACQ04756 655 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC22A25Q6T423 547 aa14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RGS19P49795 217 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB30Q15771 203 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TINAGQ9UJW2 476 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 THBS4P35443 961 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 NELFAQ9H3P2 528 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A1W2PR80 420 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CXorf65A6NEN9 183 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 LCATP04180 440 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 HEXAP06865 529 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 SULT1A1P50225 295 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF774Q6NX45 483 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 HSPB6O14558 160 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TNFSF11O14788 317 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB5AP20339 215 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM189A2Q15884 450 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 OPN5Q6U736 354 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.96□□□□□ -0.01
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 MSX1P28360 303 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC35A1P78382 337 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 HIST3H3Q16695 136 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 Q96M66 194 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.96□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 SNCAP37840 140 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 S100PBPQ96BU1 408 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 DHHO43323 396 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 IFNA4P05014 189 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 SKA3Q8IX90 412 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 RARRES3Q9UL19 164 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 KPTNQ9Y664 436 aa14.95□□□□□ -0.02
SEPHS1-201ENST00000327347 CACNA1EQ15878 2313 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms