RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TREM2Q9NZC2 230 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN25C9JDP6 229 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRR1P24046 479 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSTR2P30874 369 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK11-1P61568 191 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF45Q02386 682 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL18Q14116 193 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM21Q3B7S5 101 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGYQ3MUY2 71 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf87Q8N0U7 546 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPTNQ9Y639 398 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 H7C417 338 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPXP02790 462 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 MADCAM1Q13477 382 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST4Q8NCG5 386 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL17Q92583 94 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 POM121Q96HA1 1249 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL19Q99731 98 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 NICN1Q9BSH3 213 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKIP1Q9NQ31 210 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLS2Q9UI32 602 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 RABL2BQ9UNT1 228 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRRM5B3KS81 715 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRCC3O43542 346 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV6P41212 452 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF9Q16594 264 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF181Q2M3W8 571 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 NHLRC3Q5JS37 347 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 IZUMO1Q8IYV9 350 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB11Q9UBS4 358 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 TENM4Q6N022 2769 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT9BO14905 357 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDKN1AP38936 164 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR4A2P43354 598 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF846Q147U1 533 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 HFEQ30201 348 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00596Q86U02 117 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM89BQ8N5H3 189 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10R2Q8NGX6 335 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 HES4Q9HCC6 221 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV18A0A075B6X5 111 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BUI4 141 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 PITPNAQ00169 270 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL13RA2Q14627 380 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACP7Q6ZNF0 438 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 BIVMQ86UB2 503 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCSAMQ8N6F7 178 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf40Q8WUR7 153 aa23.1■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR13Q9H1Z4 485 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM106BQ9NUM4 274 aa23.1■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0A6YYD4 124 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A10PA6NDY2 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A18PA6NE21 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A16PA6NEW6 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A7PA6NKC0 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A22PA8MWA6 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A12PA8MX19 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHBP01229 141 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A15PP0C7V4 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A13PP0C7W8 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A14PP0C7W9 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A24PP0C7X0 464 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MPV17LQ2QL34 196 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIN3Q5JUX0 258 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3CQ96E17 227 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEDD4LQ96PU5 975 aa23.09■■□□□ 1.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS1O15524 211 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 MNDAP41218 407 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R20P59543 309 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCN1BQ07699 218 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOGAT2Q3SYC2 334 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYHIN1Q6K0P9 492 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A1Q86YD7 464 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD4AQ8N468 514 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH5Q92781 318 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLL4Q9NR61 685 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL36RNQ9UBH0 155 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNG2Q9Y698 323 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 V9GYH0 126 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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