RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC157Q569K6 752 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PDSS1Q5T2R2 415 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 IL34Q6ZMJ4 242 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 COLCA1Q6ZS62 124 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM219AQ8IW50 185 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SMIM8Q96KF7 97 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PDCD6O75340 191 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF728P0DKX0 622 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZXDAP98168 799 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 LRTM2Q8N967 370 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GUCD1Q96NT3 240 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CTRB1P17538 263 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ADCYAP1P18509 176 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM187Q14656 261 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SVBPQ8N300 66 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 Q8NFD4 153 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NAA60Q9H7X0 242 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NCKAP5O14513 1909 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PCSK5Q92824 1860 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM74A7A6NL05 159 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CST4P01036 141 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF883P0CG24 379 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 UCP3P55916 312 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PIGCQ92535 297 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TAAR9Q96RI9 348 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PRRX2Q99811 253 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 LRFN1Q9P244 771 aa14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 K7EPK0 472 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 AKR1C2P52895 323 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 AKR1C1Q04828 323 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SMCO1Q147U7 214 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 OR2A2Q6IF42 318 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 DYRK2Q92630 601 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 DDA1Q9BW61 102 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FUT3P21217 361 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MALLQ13021 153 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SPINK14Q6IE38 97 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 BRICD5Q6PL45 260 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SLC22A25Q6T423 547 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TOMM40LQ969M1 308 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MOB3AQ96BX8 217 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 STRADBQ9C0K7 418 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FRYLO94915 3013 aa14.97□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GPR31O00270 319 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 LRP3O75074 770 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NEURL1O76050 574 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 JTBO76095 146 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FCGR2CP31995 323 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms