RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603487.1

SMC2-AS1-201, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC2-AS1, Length 7,020 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EPDR1Q9UM22 224 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FZD9O00144 591 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM157CP0CG43 387 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIR2DS4P43632 304 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CYB561P49447 251 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ARSIQ5FYB1 569 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PIM3Q86V86 326 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MYADMQ96S97 322 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GMLQ99445 158 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM212A6NML5 194 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SNAI2O43623 268 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SEMG1P04279 462 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ST6GAL1P15907 406 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CD38P28907 300 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LTB4RQ15722 352 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.5□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM74A7A6NL05 159 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NPIPB9F8W1W9 429 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TAPBPO15533 448 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NPIPB7O75200 414 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CST7O76096 145 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GYPBP06028 91 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SHC1P29353 583 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRDX2P32119 198 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HYAL1Q12794 435 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TCEAL1Q15170 157 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF56Q15929 161 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM177Q53S58 311 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZSR9 355 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C14orf144Q96I85 54 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GGACTQ9BVM4 153 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM160Q9NX00 188 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TCFL5Q9UL49 500 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DPRXA6NFQ7 191 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OR51F1A6NGY5 319 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HSPB2A8KAH6 182 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HLA-DQA1P01909 254 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GABRA1P14867 456 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ID1P41134 155 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TNFRSF9Q07011 255 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOGQ13253 232 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RTP5Q14D33 572 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HSPB2Q16082 182 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PDPNQ86YL7 162 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RND1Q92730 232 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EDAQ92838 391 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ATP6V0BQ99437 205 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GALPQ9UBC7 116 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COL18A1P39060 1754 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1W2PPI3 338 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1W2PR48 441 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MAS1LP35410 378 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NXPH1P58417 271 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DUSP2Q05923 314 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CDC20Q12834 499 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RNF180Q86T96 592 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CLDN22Q8N7P3 220 aa4.49□□□□□ -1.69
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CLDN23Q96B33 292 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms