RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR52N1Q8NH53 320 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 UPRTQ96BW1 309 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 FGGYQ96C11 551 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 C10orf35Q96D05 121 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM80Q96HE8 168 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TBX15Q96SF7 602 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PKIBQ9C010 78 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NLKQ9UBE8 527 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IRGMA1A4Y4 181 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM212A6NML5 194 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR2AT4A6NND4 320 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SLC1A7O00341 560 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OGG1O15527 345 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFA2O43678 99 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 VENTXO95231 258 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PLATP00750 562 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IGKV1D-12P01611 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SFTPBP07988 381 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC159P0C7I6 412 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MYF6P23409 242 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NPY4RP50391 375 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ZP1P60852 638 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 FGF12P61328 243 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TNP2Q05952 138 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IL24Q13007 206 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 IKZF1Q13422 519 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RIPK1Q13546 671 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF573Q86YE8 665 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PP6455Q8WZ26 134 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ST8SIA4Q92187 359 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SLAMF9Q96A28 289 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RFT1Q96AA3 541 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ORAI1Q96D31 301 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SMIM19Q96E16 107 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SDSLQ96GA7 329 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SPACA5Q96QH8 159 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SLC6A7Q99884 636 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SIRPDQ9H106 197 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 VCXQ9H320 206 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF69Q9UC07 566 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 AUP1Q9Y679 476 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MT-ND2P03891 347 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF20P17024 532 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 MYL12AP19105 171 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 BCL3P20749 454 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 NPBWR2P48146 333 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SOX2P48431 317 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 POU3F4P49335 361 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 FUT6P51993 359 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 DLX1P56177 255 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC33-211ENST00000563951 SLC35A2P78381 396 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms